Nouvelle-Calédonie Vanuatu

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Plateforme du vivant

Sommaire

Présentation

La plateforme de recherche pour les Sciences du Vivant de Nouvelle-Calédonie (PFV) regroupe des activités de biologie moléculaire nécessitant un investissement en matériel de pointe et un budget de fonctionnement important. Sa création résulte de la volonté de cinq établissements de recherche de mutualiser leurs équipements :

  • l’Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
  • l’Institut Agronomique néo-Calédonien (IAC)
  • l’Institut Français de Recherches pour l’Exploitation de la MER (IFREMER)
  • l’Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie (IPNC) et
  • l' Université de Nouvelle-Calédonie (UNC).

Il s’agissait d’acquérir des outils moléculaires performants permettant l’évaluation de la biodiversité terrestre et marine afin de :

  • développer une gestion optimisée de ces ressources-clés pour le développement durable
  • approfondir les connaissances des « processus du vivant » en analysant la dynamique et la distribution spatiale des gènes et de leur expression dans les écosystèmes régionaux
  • fédérer et structurer en Nouvelle-Calédonie un pôle d’excellence scientifique et de formation dans ce domaine scientifique, permettant l’investigation du vivant de la cellule à l’écosystème.

Les équipements

Inaugurée en 2008 grâce à un financement incitatif de 20.000 euros de l’IRD, la plate-forme du vivant dispose, dans un espace dédié de 25 m² sur le centre de Nouméa, d’un plateau technique de biologie moléculaire composé d'appareils spécifiques à la recherche en biologie moléculaire et de matériels informatiques liés :

  • Genetic analyzer 3130XL
  • Thermocycleur GenAmp 9700
  • Thermocycleur Q-PCR 7300
  • Thermocyleur VERITI
  • NanoDrop ND-1000
  • Agitateur Incubateur orbital 420
  • Congélateur -86°C
  • Centrifugeuse 3L CR4i

Les projets scientifiques utilisant la plate-forme

Plusieurs projets conduits par les partenaires de la PFV utilisent le plateau technique de biologie moléculaire, parmi lesquels :

Projets IRD

© IRD / CIRAD / M. Ducousso Exemple d’analyses : mesure des teneurs en divers éléments dans les organes des plantes.

  • diversité et hybridation des caféiers de Nouvelle-Calédonie (UMR DIAPC)
  • phylogénie et biodiversité des algues brunes Dictyota en Nouvelle-Calédonie
  • taxonomie de plathelminthes parasites de poissons
  • diversité génétique des zooxanthèles des coraux de Nouvelle-Calédonie (UMR SAE)
  • phylogénie et structuration spatiale de la diversité de champignons ecto et endo-mycorhiziens (UMR LSTM)
  • phylogénie et taxonomie des Psychotria de Nouvelle-Calédonie (US Biodival)
  • diversité spécifique de la flore microperforante des récifs coralliens de Nouvelle-Calédonie (UR Camelia).

Projets IAC (Institut agronomique néo-calédonien)

  • structuration spatiale de la diversité de Santalum australocaledonicum à l’échelle de l’aire de répartition Nouvelle-Calédonie / Vanuatu
  • diversité génétique et adaptation édaphique du Niaouli
  • diversité génétique et adaptation édaphique de Psychotria , Tristaniopsis , Phyllanthus et Planchonella
  • protection et conservation de Pittosporum tanianum

Projets IPNC (Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie)

  • recensement, identification et épidémiologie des souches de Leptospiroses en Nouvelle-Calédonie

Projets UNC (Université de la Nouvelle-Calédonie)

© UNC Arbuscules dans une racine de Premna serratifolia (forêt sèche)

© UNC Etude de la tolerance au nickel, chez Alphitonia neocaledonia

  • identification et phylogénie des endomycorhizes associés à Psychotria

projets IFREMER

© IFREMER / H. Lemonnier Styli en bassin

© IFREMER Post-larve de crevette

  • mesure de la virémie absolue du virus IHHNV de la crevette